O Museu Professor Pepe é o primeiro da região dedicado à paleontologia, ciência que estuda as diferentes formas de vida na Terra em períodos geológicos passados. A região de Presidente Prudente é reconhecida internacionalmente por seus sítios paleontológicos, graças a descobertas. Durante suas pesquisas de campo, encontrou fósseis de espécies inéditas, incluindo dinossauros, tartarugas e crocodilos, contribuindo significativamente para a paleontologia nacional.